Des scientifiques développent un test de détection rapide du génotype et du phénotype

Annonce : S’agissant de l’information à propos des rappels de produits alimentaires, pour le moment, il ne faut pas faire confiance à nos autorités sanitaires (Ministère de l’agriculture et DGCCRF). Ces deux entités ont fait et font toujours preuve d’une incroyable légèreté et d’un manque d’informations fiables vis-à-vis des consommateurs avec comme corollaire une absence de transparence en matière de sécurité des aliments.

« Des scientifiques développent un test de détection rapide du génotype et du phénotype », source CIDRAP News.

Des scientifiques de l'Université de Harvard et du Massachusetts Institute of Technology ont déclaré qu'un test de diagnostic qu'ils avaient mis au point permettait la détection simultanée du génotype et du phénotype, permettant une détermination rapide et précise de la sensibilité aux antibiotiques en moins de 4 heures, selon leurs résultats détaillés dans une lettre de Nature Medicine.

Les auteurs notent que les tests basés sur la croissance sont limités par la vitesse à laquelle les bactéries se reproduisent et que les tests génotypiques sont limités par la diversité et la complexité sans cesse croissantes des mécanismes de résistance aux antibiotiques chez les bactéries.

Ils ont donc mis au point un test de sensibilité aux antibiotiques (AST) qui détecte à la fois le génotype et le phénotype des microbes afin d’augmenter la vitesse et la précision.

Leur test, GoPhAST-R (combinaison génotypique et phénotypique du test de senstibilité aux antibiotiques via la détection d'ARN - GoPhAST-R se prononce « go faster ») peut détecter le génotype et le phénotype d'un pathogène en un seul test rapide qui génère simultanément des données sur la prédiction de la résistance et l'épidémiologie moléculaire.

Le test détecte des signatures spécifiques de l'expression de l'ARN messager chez les bactéries après une brève exposition aux antibiotiques. Les scientifiques ont validé le test en utilisant trois classes d'antibiotiques courants, les fluoroquinolones, les aminosides et les carbapénèmes, chez cinq pathogènes à tendance multirésistants.

Ils ont déterminé une précision de 94% à 99% dans les 4 heures à l'aide d'échantillons de sang et ont constaté que leur approche produisait des informations sur le phénotype 24 à 36 heures plus rapidement que les autres tests.

Les auteurs concluent que « GoPhAST-R offre la possibilité d’obtenir un test phénotypique de sanibilité aux antibiotiques encore plus rapide sur des échelles de temps permettant d’éclairer les premières décisions relatives aux antibiotiques et de transformer ainsi la pratique en matière de maladies infectieuses. »